MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	GAAA	2	8	246	253	75 %	0 %	25 %	0 %	385836927
2	NC_017493	AAGG	2	8	278	285	50 %	0 %	50 %	0 %	385836927
3	NC_017493	AGCT	2	8	352	359	25 %	25 %	25 %	25 %	385836927
4	NC_017493	CTC	2	6	382	387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836927
5	NC_017493	ATA	2	6	394	399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836927
6	NC_017493	A	6	6	413	418	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
7	NC_017493	ATT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
8	NC_017493	T	7	7	431	437	0 %	100 %	0 %	0 %	385836927
9	NC_017493	TGATAA	2	12	446	457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385836927
10	NC_017493	TCG	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836927
11	NC_017493	A	6	6	484	489	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
12	NC_017493	T	6	6	503	508	0 %	100 %	0 %	0 %	385836927
13	NC_017493	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
14	NC_017493	A	6	6	644	649	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
15	NC_017493	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
16	NC_017493	TA	3	6	712	717	50 %	50 %	0 %	0 %	385836927
17	NC_017493	GAA	2	6	776	781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
18	NC_017493	ATA	2	6	810	815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836927
19	NC_017493	TGA	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
20	NC_017493	TAG	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
21	NC_017493	A	6	6	877	882	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
22	NC_017493	AAAT	2	8	907	914	75 %	25 %	0 %	0 %	385836927
23	NC_017493	A	7	7	942	948	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
24	NC_017493	A	7	7	950	956	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
25	NC_017493	ATG	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
26	NC_017493	GAA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
27	NC_017493	TGT	2	6	1138	1143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836927
28	NC_017493	GAA	2	6	1267	1272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
29	NC_017493	ATT	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
30	NC_017493	GGT	2	6	1555	1560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836928
31	NC_017493	ATA	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836928
32	NC_017493	ATT	2	6	1623	1628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
33	NC_017493	A	6	6	1646	1651	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
34	NC_017493	ATTTTA	2	12	1679	1690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
35	NC_017493	CTA	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836928
36	NC_017493	A	7	7	1757	1763	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
37	NC_017493	AGA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
38	NC_017493	TAA	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836928
39	NC_017493	ATT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
40	NC_017493	TTAT	2	8	1843	1850	25 %	75 %	0 %	0 %	385836928
41	NC_017493	A	6	6	1860	1865	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
42	NC_017493	ATTAT	2	10	1892	1901	40 %	60 %	0 %	0 %	385836928
43	NC_017493	TTA	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
44	NC_017493	A	6	6	2037	2042	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
45	NC_017493	GTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836928
46	NC_017493	T	6	6	2094	2099	0 %	100 %	0 %	0 %	385836928
47	NC_017493	A	6	6	2154	2159	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
48	NC_017493	ATG	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836928
49	NC_017493	AAG	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
50	NC_017493	CTT	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836928
51	NC_017493	ATT	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
52	NC_017493	AGA	2	6	2244	2249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
53	NC_017493	AAAT	2	8	2271	2278	75 %	25 %	0 %	0 %	385836928
54	NC_017493	CAT	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836928
55	NC_017493	A	7	7	2292	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
56	NC_017493	A	6	6	2835	2840	100 %	0 %	0 %	0 %	385836929
57	NC_017493	TGA	2	6	2882	2887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836929
58	NC_017493	CAT	2	6	2897	2902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
59	NC_017493	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
60	NC_017493	TA	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	385836929
61	NC_017493	TCA	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
62	NC_017493	TTC	2	6	3093	3098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836929
63	NC_017493	CCCT	2	8	3108	3115	0 %	25 %	0 %	75 %	385836929
64	NC_017493	AAT	2	6	3134	3139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
65	NC_017493	TTC	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836929
66	NC_017493	AAT	2	6	3189	3194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
67	NC_017493	ATT	2	6	3243	3248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
68	NC_017493	CTTT	2	8	3311	3318	0 %	75 %	0 %	25 %	385836929
69	NC_017493	AGA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836929
70	NC_017493	T	6	6	3364	3369	0 %	100 %	0 %	0 %	385836929
71	NC_017493	TAA	2	6	3476	3481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
72	NC_017493	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
73	NC_017493	ATTTT	2	10	3529	3538	20 %	80 %	0 %	0 %	385836929
74	NC_017493	T	7	7	3535	3541	0 %	100 %	0 %	0 %	385836929
75	NC_017493	GAT	2	6	3547	3552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836929
76	NC_017493	ACT	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
77	NC_017493	GAC	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836929
78	NC_017493	A	6	6	4386	4391	100 %	0 %	0 %	0 %	385836930
79	NC_017493	ACA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836930
80	NC_017493	GT	3	6	4417	4422	0 %	50 %	50 %	0 %	385836930
81	NC_017493	GAAA	2	8	4428	4435	75 %	0 %	25 %	0 %	385836930
82	NC_017493	AGAAA	2	10	4439	4448	80 %	0 %	20 %	0 %	385836930
83	NC_017493	TTG	2	6	4451	4456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836930
84	NC_017493	TCA	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836930
85	NC_017493	ATT	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
86	NC_017493	T	7	7	4596	4602	0 %	100 %	0 %	0 %	385836930
87	NC_017493	AAG	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
88	NC_017493	A	6	6	4649	4654	100 %	0 %	0 %	0 %	385836930
89	NC_017493	T	7	7	4668	4674	0 %	100 %	0 %	0 %	385836930
90	NC_017493	AAG	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
91	NC_017493	TGGAA	2	10	4736	4745	40 %	20 %	40 %	0 %	385836930
92	NC_017493	TTGA	2	8	4798	4805	25 %	50 %	25 %	0 %	385836930
93	NC_017493	AGTA	2	8	4858	4865	50 %	25 %	25 %	0 %	385836930
94	NC_017493	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
95	NC_017493	G	6	6	4930	4935	0 %	0 %	100 %	0 %	385836930
96	NC_017493	TACT	2	8	4997	5004	25 %	50 %	0 %	25 %	385836930
97	NC_017493	AGA	2	6	5067	5072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
98	NC_017493	AGA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
99	NC_017493	TTA	2	6	5248	5253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
100	NC_017493	AGTA	2	8	5269	5276	50 %	25 %	25 %	0 %	385836930
101	NC_017493	ATT	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
102	NC_017493	AAG	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
103	NC_017493	A	6	6	5479	5484	100 %	0 %	0 %	0 %	385836930
104	NC_017493	CTAC	2	8	5500	5507	25 %	25 %	0 %	50 %	385836930
105	NC_017493	T	9	9	5991	5999	0 %	100 %	0 %	0 %	385836931
106	NC_017493	TTTA	2	8	6018	6025	25 %	75 %	0 %	0 %	385836931
107	NC_017493	CTGTT	2	10	6051	6060	0 %	60 %	20 %	20 %	385836931
108	NC_017493	TCA	2	6	6061	6066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836931
109	NC_017493	AATT	2	8	6117	6124	50 %	50 %	0 %	0 %	385836931
110	NC_017493	T	7	7	6135	6141	0 %	100 %	0 %	0 %	385836931
111	NC_017493	ATT	2	6	6162	6167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836931
112	NC_017493	TCTT	2	8	6216	6223	0 %	75 %	0 %	25 %	385836931
113	NC_017493	GTT	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836931
114	NC_017493	T	7	7	6282	6288	0 %	100 %	0 %	0 %	385836931
115	NC_017493	TGA	2	6	6301	6306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836931
116	NC_017493	T	6	6	6348	6353	0 %	100 %	0 %	0 %	385836931
117	NC_017493	TAA	2	6	6903	6908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836932
118	NC_017493	TTTTA	2	10	6945	6954	20 %	80 %	0 %	0 %	385836932
119	NC_017493	A	6	6	7013	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	385836932
120	NC_017493	A	6	6	7029	7034	100 %	0 %	0 %	0 %	385836932
121	NC_017493	ATTTT	2	10	7052	7061	20 %	80 %	0 %	0 %	385836932
122	NC_017493	GAA	3	9	7084	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
123	NC_017493	AAG	2	6	7094	7099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
124	NC_017493	ATT	2	6	7112	7117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836932
125	NC_017493	CATGG	2	10	7138	7147	20 %	20 %	40 %	20 %	385836932
126	NC_017493	ACA	2	6	7204	7209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
127	NC_017493	A	8	8	7250	7257	100 %	0 %	0 %	0 %	385836932
128	NC_017493	ATG	2	6	7268	7273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836932
129	NC_017493	AAAGA	2	10	7297	7306	80 %	0 %	20 %	0 %	385836932
130	NC_017493	A	6	6	7328	7333	100 %	0 %	0 %	0 %	385836932
131	NC_017493	TAA	2	6	7395	7400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836932
132	NC_017493	A	8	8	7409	7416	100 %	0 %	0 %	0 %	385836932
133	NC_017493	GAAA	2	8	7460	7467	75 %	0 %	25 %	0 %	385836932
134	NC_017493	CAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
135	NC_017493	ACAA	2	8	7580	7587	75 %	0 %	0 %	25 %	385836932
136	NC_017493	AAAGA	2	10	7609	7618	80 %	0 %	20 %	0 %	385836932
137	NC_017493	CAAA	2	8	7621	7628	75 %	0 %	0 %	25 %	385836932
138	NC_017493	AAC	2	6	7741	7746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
139	NC_017493	CAAGAA	2	12	7789	7800	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385836932
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430	NC_017493	CTT	2	6	25470	25475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836949
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